
Los queridos personajes de Madagascar, Alex el león, Marty la cebra, Melman la jirafa y Gloria la hipopótamo, han permanecido por un largo tiempo en la isla tropical de Madagascar, donde la libertad les ha otorgado momentos únicos de diversión y emoción. Sin embargo, el deseo de regresar a su hogar, el zoológico de Nueva York, nunca se desvanece en sus corazones. Después de todo, la vida en la isla, aunque emocionante, no es comparable con la comodidad de la vida en su antiguo hogar.
Decididos a volver, los animales se embarcan en una nueva misión: encontrar una forma de regresar a su hogar. Tras varias ideas fallidas y tras muchos intentos, descubren un antiguo avión que ha quedado abandonado en la isla. Aunque el aparato está en malas condiciones, los amigos no se rinden. Utilizando su ingenio y habilidades, se embarcan en la restauración del aeroplano, con la esperanza de que les permita volar de regreso a Nueva York.
Lo que no esperan es que el avión no los lleve a casa, sino hacia una nueva aventura. Después de varios obstáculos en el aire, logran llegar a África, un lugar que ninguno de ellos había visitado antes. Las vastas llanuras africanas se abren ante ellos como un mundo completamente distinto, lleno de desafíos, criaturas sorprendentes y paisajes desconocidos. A pesar de las dificultades, los amigos están decididos a adaptarse y disfrutar de lo que esta nueva etapa les tiene preparado.
Lo que parecía ser un simple regreso a su zoológico, pronto se convierte en un viaje de autodescubrimiento y crecimiento personal. En África, los animales no solo se enfrentan a nuevas situaciones, sino que también descubren más sobre sí mismos y sus raíces. Desde el encuentro con especies de animales nunca antes vistas hasta la necesidad de superar obstáculos juntos, el grupo se ve obligado a confiar más que nunca en su amistad y en su capacidad para enfrentarse a lo desconocido.